What is DENIS@home?

More than 17 million people die each year of cardiovascular diseases (CVDs). That represents 31% of all global deaths, making these diseases the leading cause of death worldwide. Can you help us investigate it?

By join DENIS@home you will donate the iddle times of your computer to develop and simulate mathematical models that investigate the heart. You only need to download and run a free program on your computer.

Electrophysiological models are a powerful tool to study the electrical activity of cardiac cells under normal or pathological conditions. These models can also help predict the effects of drugs in the heart. These models are complex and it's neccessary to simulate them many times (varying the conditions or model parameters). For this reason, researchers in this field usually require high computational power. We have created DENIS@home as a simulation infrastructure to help researchers. Will you help us?

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News

New simulations // Nuevas simulaciones
Dear volunteers:
As we had indicated in previous messages, we had to stop fitting the model because there was an experiment that we could not fit well. After analyzing our results, we believe that one of the limiting factors could be in the number of simulations we do to fit the behavior of the model in the experiment. Therefore, before continuing with the model fit, we are going to do a new test to study this in detail. We just put in new simulations to help us analyze this experiment to see if we can improve the model and its fit.

Thank you for your patience during this break. After analyzing the results of this experiment we hope to be able to resume the simulations.

Best,
Jesús

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Estimados voluntarios:
Tal y como os habíamos indicado en mensajes anteriores, habíamos tenido que parar el ajuste del modelo porque había un experimento que no conseguíamos ajustar bien. Después de analizar nuestros resultados, creemos que uno de los factores limitantes podría estar en el número de simulaciones que hacemos para ajustar el comportamiento del modelo en el experimento. Por ello, antes de continuar con el ajuste del modelo vamos a hacer una nueva prueba para estudiar esto en detalle. Acabamos de poner nuevas simulaciones que nos ayuden a analizar este experimento para ver si podemos mejorar el modelo y su ajuste.

Gracias por la paciencia en este parón. Después de analizar los resultados de este experimento esperamos poder retomar las simulaciones.

Un saludo,
Jesús.
17 Jan 2023, 10:56:05 UTC · Discuss


The pause of tasks will continue until January // La parada de tareas se mantendrá hasta enero
Dear volunteers,
Due to work overload in other projects we will not be able to restart sending tasks until January. Sorry that this break is taking longer than expected, we want to get back as soon as possible.

All the best,
Jesus.

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Estimados voluntarios:
Debido a sobrecarga de trabajo en otros proyectos no vamos a poder relanzar el envío de tareas hasta enero. Disculpad que esta pausa esté siendo más larga de lo esperada, queremos volver cuanto antes.

Un saludo,
Jesús.
25 Nov 2022, 9:04:10 UTC · Discuss


Temporary stop of tasks // Parada temporal de las tareas
Hello everyone:
First of all, excuse these days without notices from us, but the start of the course has required more time than we expected and we have not been able to be as active as we would like in the project.

We update you on how the optimization of the model is going: after 3 iterations of the algorithm, the model is gradually improving, but one of the markers is greatly limiting the improvement. We full understand why this is happening, so we need to stop and analyze it in detail before continuing.

Thanks to all the simulations you have done we have a wide variety of situations to study and we hope to resume the simulations shortly (ideally 1 week, but it is easy for it to be two).

On the other hand, the applications that we had in Beta mode have already been sufficiently analyzed to be considered stable, and until we modify the application again, the beta tasks will be stopped.

Thank you very much and we will keep you informed shortly.

All the best,
Jesus.

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Hola a todos:
En primer lugar, disculpad estos días de parón sin notificar, pero el arranque de curso nos ha requerido más tiempo del que esperábamos y no hemos podido estar todo lo activos que querríamos en el proyecto.

Os ponemos al día de cómo va la optimización del modelo: tras 3 iteraciones del algoritmo, el modelo va poco a poco mejorando, pero uno de los marcadores está limitando muchísimo la mejoría. No tenemos del todo claro por qué está sucediendo, pero necesitamos para y analizarlo en detalle antes de continuar.

Gracias a todas las simulaciones que habéis hecho hasta el momento tenemos gran variedad de situaciones para estudiar y esperamos reanudar las simulaciones en breve (idealmente 1 semana, pero es fácil que sean dos).

Por otro lado, las aplicaciones que teníamos en modo Beta están ya suficientemente analizadas como para considerarlas estables, y hasta que no modifiquemos de nuevo la aplicación, las tareas beta estarán paradas.

Muchas gracias y seguiremos informando en breve.

Un saludo,
Jesús.
26 Sep 2022, 4:49:42 UTC · Discuss


Review of the electrical installation of the University // Revisión de la instalación eléctrica de la Universidad
Hi!
Due to a review of the electrical installation of the University, DENIS@home could be temporarily out of service today between 15:00 and 20:00 CEST.

Sorry for any inconvenience it may cause.

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Hola!
Debido a una revisión de la instalación eléctrica de la Universidad, DENIS@home podría estar temporalmente fuera de servicio hoy entre las 15:00 y las 20:00 CEST.


Disculpad los inconvenientes que pueda causar.
25 Aug 2022, 10:56:02 UTC · Discuss


Status of the proyect // Estado del proyecto
Hello!
I am writing this post to summarize a little the news that we have had over the last month. As we have already commented on the forums, we detected a problem with the checkpoint files that caused many windows tasks to end with an invalid result. After several tests and several attempts we have managed to detect where the problem was and solve it. Due to this, we have implemented some of the improvements that we had planned for the checkpoint file. We have made it more robust. We have kept it as beta for quite a few days and it seems that the problem is fixed. We will continue to analyze how the program works, but the percentage of errors that we receive is more than reasonable in a project of these characteristics.

A special thanks to all of you who have been giving us feedback and helping us find the problem.

Today we have re-launched simulations in the NHuVe project. These tasks are no longer beta. We will inform you of the status of that project as we receive results. In the coming weeks we also plan to add tasks to the HuVeMOp project. With both projects working we hope to have a fairly stable flow of tasks.

On the other hand, we have been working on expanding the number of platforms and we have added in beta mode an application for ARM64 on linux (e.g. RaspberryPi), and ARM for Apple (for new Apple chips). We want to see how well they work. If all goes well, in the short term we could also consider expanding to Android.

All the best,
Jesus.

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Hola!
Os escribo este post para resumir un poco las novedades que hemos tenido a lo largo del último mes. Como ya hemos comentado por los foros, detectamos un problema con los ficheros de checkpoint que hacía que muchas tareas de windows terminaran con un resultado invalido. Después de varias pruebas y varios intentos hemos conseguido detectar dónde estaba el problema y solucionarlo. Debido a esto, hemos adelantado algunas de las mejoras que teníamos pensadas para el fichero de checkpoint y hemos aprovechado para hacerlo más robusto. Hemos mantenido la versión beta durante bastantes días y parece que el problema está solucionado. Seguiremos analizando cómo funciona el programa, pero el porcentaje de errores que recibimos es más que razonable en un proyecto de estas características.

Un agradecimiento especial a todos aquellos que nos habéis estado dando feedback y ayudando en la búsqueda del problema.

Gracias a esto, hoy hemos vuelto a lanzar simulaciones en el proyecto NHuVe. Estas tareas ya no son beta. Os iremos informando del estado de ese proyecto según vayamos recibiendo resultados. En las próximas semanas planeamos también añadir tareas al proyecto HuVeMOp. Con ambos proyectos en marcha esperamos tener un flujo bastante estable de tareas.

Por otro lado, hemos estado trabajando en ampliar el número de plataformas del proyecto y vamos a poner en modo beta una aplicación para ARM64 sobre linux (e.g. RaspberryPi), y ARM para Apple (para los nuevos chips de Apple). Queremos ver qué tal funcionan. Si todo va bien, en un corto plazo nos podríamos plantear también ampliar a Android.

Un saludo,
Jesús.
17 Aug 2022, 7:05:06 UTC · Discuss


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